GENÉTICA MOLECULAR Y GENÓMICA VEGETAL
El principal objetivo de este grupo de investigación es el desarrollo de proyectos que utilizan información de secuencias de ADN y expresión de genes (transcriptómica). Además se han incorporado líneas de trabajo tendientes a resolver problemáticas de sanidad planteadas por sistemas productivos a nivel regional. Estas temáticas se desarrollan en el contexto de vinculaciones con otras universidades, estaciones de INTA y empresas privadas. En el marco de las actividades de investigación se realiza una activa formación de recursos humanos y se transfieren conocimientos a nivel de grado y posgrado.
Líneas de Investigación
- Análisis del perfil transcriptómico de la respuesta a frío en trigo candeal mediante ARN-Seq y evaluación de daño por frío a campo. En colaboración con INTA Chacra Barrow.
- Identificación de genes responsables de la resistencia a fusariosis de la espiga en trigo candeal (expresión diferencial y mapeo). En colaboración con Servicio de Bioinformática, CREA - Genomics Research Centre – Italia, empresas semilleras argentinas y UNRC.
- Aportes para el control de mildiu de girasol: análisis de la variabilidad genética de Plasmopara halstedii y determinación de raza, detección molecular del patógeno en planta y semilla, búsqueda de fuentes de resistencia. En colaboración con EEA Balcarce, ACA Pergamino y grupo Recursos Genéticos CERZOS (A. Presotto; S Ureta, C Pandolfo y A. Gutierrez).
- Evaluación de materiales de Panicum coloratum var makarikariense como alternativa de pastura en el sudoeste bonaerense. En colaboración con INTA Agencia Bahía Blanca y EEA Rafaela.
- Análisis estadístico de datos fenotípicos y moleculares: métodos y softwares.
Publicaciones recientes
- Díaz, M., Soresi, D., Basualdo, J., Cuppari, S. & Carrera, A. (2019). Transcriptomic response of durum wheat to cold stress at reproductive stage. Molecular Biology Reports 46, 2427–2445. https://doi.org/10.1007/s11033-019-04704-y
- Soresi, D.S., Zappacosta, D., Garayalde, A., Irigoyen, I., Basualdo, J. & Carrera, A. (2017). A valuable QTL for Fusarium head blight resistance from Triticum turgidum L. ssp. dicoccoides has a stable expression in durum wheat cultivars. Cereal Research Communications 45(2), 185-197. DOI: 10.1556/0806.45.2017.007
- Díaz, M.L., Cuppari, S., Soresi, D.S. & Carrera, A. (2017). In Silico Analysis of Fatty Acid Desaturase Genes and Proteins in Grasses. Applied Biochemistry and Biotechnology 184(2), 484-499.
- Armando, L.V., Tomás, M.A., Garayalde, A.F. & Carrera, A.D. (2017). Effect of pollination mode on progeny of Panicum coloratum var. makarikariense: Implications for conservation and breeding. Tropical Grasslands-Forrajes Tropicales, 5(3), 117–128. DOI: 10.17138/TGFT(5)117-128.
- Basualdo, J., Díaz, M.L., Cuppari, S., Cardone, S., Soresi, D.S., Pérez Camargo, G. & Carrera, A. (2015). Allelic variation and differential expression of VRN-1A gene in durum wheat genotypes varying in vernalization response. Plant Breeding 134, 520-528. DOI: 10.1007/s11032-014-0072-9.
- Soresi, D.S., Zappacosta, D., Garayalde, A., Miranda, R. & Carrera A. (2015). An in vitro assay for pre-screening resistance to Fusarium head blight in durum wheat. Phytopathologia Mediterranea 54(2), 253-264. DOI: 10.14601/Phytopathol_Mediterr-14986.
- Soresi, D.S., Carrera, A., Echenique, V. & Garbus I. (2015). Identification of genes induced by Fusarium graminearum inoculation in the resistant durum wheat line Langdon(Dic-3A)10 and the susceptible parental line Langdon. Microbiological Research 177, 53-66. DOI: 10.1016/j.micres.2015.04.012.
- Armando, L.V., Tomás, M.A., Garayalde, A.F. & Carrera, A.D. (2015). Assessing the genetic diversity of Panicum coloratum var. makarikariense using agro-morphological traits and microsatellite-based markers (2015). Annals of Applied Biology 167(3), 373-386. DOI: 10.1111/aab.12234.
- Garayalde, A.F., Presotto, A., Carrera, A., Poverene, M. & Cantamutto, M. (2015). Characterization of a new male sterility source identified in an invasive biotype of Helianthus annuus (L.). Euphytica 206, 579–595. DOI: 10.1007/s10681-015-1456-6.
Financiamiento
- PIT-AP-BA “Estrategias integradas para evitar la ocurrencia de epifitias del mildiu del girasol en el SE de Bs. As.” Proyectos de Innovación y Transferencia en Áreas Prioritarias de la Provincia de Buenos Aires. CIC. 2016-2018. Monto 351.750$. Resp. Alicia Carrera.
- PCESU9-UNS976 “Aplicación de herramientas genéticas para la identificación de marcadores asociados a la resistencia a enanismo (mildiu) de girasol”. Programa de Cooperativismo y Economía Social en la Universidad. 2017. Ministerio de Educación. Monto 244.500$. Resp. Alicia Carrera.
- PGI SECyT UNS 24/A223 “Caracterización de genes involucrados en la tolerancia a estreses abióticos y en la interacción con herbicidas y patógenos”. 2016-2019. Resp. Alicia Carrera.
- PGI SECyT Estudios de la relación entre la expresión de genes y el nivel de tolerancia a frío en Triticum turgidum spp. durum.(2018-2019). Resp. Marina L. Díaz.
- PGI SECyT UNS 24/B228. “Las desaturasas y la respuesta a frío en Triticum turgidum ssp. durum”. (2016 – 2017). Resp. Marina L. Díaz.
- CIC Subsidio semi-automático para Investigadores. 2017 - 2019. Resp. Marina L. Díaz.
- PICT-2017-1178. “Análisis genómico de la región Qfhs.ndsu-3AS que confiere resistencia a la fusariosis de la espiga en trigo” (2018-2020). Resp. Daniela Soresi.
Colaboraciones nacionales e internacionales
- Empresas: Asociación de Cooperativas Argentinas, ACA Cabildo (Ing. Rubén Miranda) y Pergamino (Lic. Mauro Meier) y Buck Semillas (Ing. Lisardo González).
- INTA: EEA Balcarce (Dr. Facundo Quirós), Chacra Barrow Barrow (Dra. Adelina Larsen y Dra. Liliana Werhane), EEA Rafaela (Dra. Andrea Tomás) y Agencia Bahía Blanca (Dr. Carlos Torres Carbonell).
- Universidad Nacional de Río Cuarto - Departamento de Microbiología e Inmunología (Dra. Adriana Torres, Dra. Cecilia Farnocchi, Dra. Sofía Palacios).
- Servicio de Bioinformática y Bioestadística del Centro de Investigaciones Biológicas (CIB), del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) - Madrid, España (Dr. Mario García Lacoba).
- Servicio de Bioinformática, CREA - Genomics Research Centre – Italia (Dr. Paolo Bagnaresi).
Integrantes
Dra. Marina Lucía Díaz
Investigadora Adjunto, CIC
Asistente de docencia,
Depto. Biología, Bioquímica y Farmacia - UNS
Dra. Daniela Soresi
Becaria Posdoctoral, CONICET
Ayudante de docencia,
Depto. Biología, Bioquímica y Farmacia - UNS
Dr. Antonio Garayalde
Asistente de docencia,
Depto de Matemática - UNS
Dra. Lorena Armando
Ayudante de docencia,
Depto Agronomía - UNS
Ing. Selva Cuppari
Becaria Doctoral, CONICET
Ayudante de docencia,
Depto Agronomía - UNS
Ing. Ana Laura Martínez
Becaria Doctoral, CONICET