MOLECULAR GENETICS AND PLANT GENOMICS

Director: Dr. Alicia Carrera
Independent Researcher, CERZOS
Professor, Department of Agronomy,  UNS

The main objective of this group is to evaluate the effects of biotic and abiotic stresses at molecular level in sunflower and durum wheat, with the main goal of identifying new resistance sources. 

We use transcriptomics technologies, such as RNA-seq, to  study the cold response in Triticum durum in collaboration with INTA Chacra Barrow. Also in the identification of candidate genes for resistance to Fusarium in durum wheat.

Lines of Research

• Mildew control on sunflower including the analysis of Plasmopara halstedii genetic variability and race determination, pathogen molecular detection in plant seed and search for resistance sources.

• Transcriptomic profile analysis of the response to cold stress in durum wheat via ARN-Seq.

• Identification of genes responsible for resistance to Fusarium in durum wheat spikes (differential expression analysis and mapping).

• Evaluation of Panicum coloratum var makarikariense as a pasture alternative in the southwest of Buenos Aires province, Argentina.

Recent publications

• Martínez AL, Anderson F, Garayalde A, Sabatini P, Presotto A, Gutiérrez A, Hernández F, Pandolfo C, Ureta MS, Carrera A. 2024. Characterisation of Argentinian wild Helianthus annuus populations in their responses to Plasmopara halstedii infection. Canadian Journal of Plant Pathology. En prensa.

• Lorena V. Armando, Carlos Torres Carbonell, María Andrea Tomás, Alicia D. Carrera. 2023. Experiencia de incorporación de una gramínea megatérmica en un establecimiento ganadero del sudoeste bonaerense. Manual: Prácticas agronómicas para el sudoeste bonaerense enfocadas a disminuir la unidad económica rural. Departamento Agronomía. UNS. En prensa.

• Armando L, Torres Carbonell C, Tomas M A, Torres Y, Lauric MA, De Leo G, Carrera A. Implantación y comportamiento productivo de dos cultivares de Panicum coloratum en un sistema ganadero del sudoeste bonaerense. INTA Digital. 2023. https://repositorio.inta.gob.ar/handle/20.500.12123/14162

• Martínez A L, Bazzalo M E, Huguet N, Bertero A, Erreguerena I, Faberi A, Petrucelli M, Bannister J, Di Giano F, Della Maddalena M, Piubello S, Carrera A, Quiroz F. 2022. Races and oomyceticide tolerances of Plasmopara halstedii in Argentina. 20th International Sunfower Conference, Novi Sad, Serbia, June 20-23.

• Soresi D^*, Díaz M*, Bagnaresi P, Gallo C, Carrera A. 2022. Gene and lncRNA expression patterns associated with Qfhs.ndsu-3AS Fusarium head blight resistance QTL in durum wheat. Canadian Journal of Plant Pathology, DOI:10.1080/07060661.2022.2091663. (*) Contribuyeron equitativamente.

• Soresi D, Bagnaresi P, Crescente JM, Díaz M, Cattivelli L, Vanzetti L, Carrera A. Genetic characterization of a Fusarium head blight resistance QTL from Triticum turgidum ssp. dicoccoides. 2021. Plant Molecular Biology Reporter.39:710–726 https://doi.org/10.1007/s11105-020-01277-0.

• Viceconte FR, Diaz ML, Soresi DS, Lencinas IB, Carrera A, Prat MI, Vela Gurovic MS. 2021. Ganoderma sessile is a fast polysaccharide producer among Ganoderma species. Mycologia113: 513-524.

• Martínez A L, Quiroz F, Carrera A. 2021. Detection of Plasmopara halstedii in sunflower seeds: A case study using molecular testing. Journal of the Saudi Society of Agricultural Sciences 6: 395-400. 

• Carrera A. 2021. Capítulo 1. Investigación y transferencia en vinculaciones UNS – Empresas semilleras en el área de genómica y biotecnología. En: Alcances y desafíos de la vinculación tecnológica para la transformación social. Javier Lottersberger y Celso Garrido Noguera (eds). 523 p. REDUE-UNL-UDUAL: 11-29. ISBN 978-607-8496-12-9.

• Martínez A L, Garayalde A, Petruccelli M, Erreguerena I, Quiroz F, Carrera A. Genetic characterization of Plasmopara halstedii populations in Argentina using simple sequence repeats (SSR) and effector-based markers. 2021, 15-16 de junio, North Central Division Meeting, The American Phytopathological Society (APS), Iowa, Estados Unidos.

• Armando LV*, Giordano MC*, Carrera AD, Tomás MA. 2022. Mejoramiento genético en Panicum coloratum en INTA EEA Rafaela. En: Avances en el mejoramiento genético de forrajeras en la Argentina / compilación de Gustavo E. Schrauf. - 1a ed adaptada. - Ciudad Autónoma de Buenos Aires: Orientación Gráfica Editora, 304 p.; 24 x 16 cm. ISBN 978-987-1922-46-8. 1. Plantas Forrajeras. I. Título. CDD 633.208. (*) Contribuyeron equitativamente.

• Martínez A L, Carrera A. 2020. Mildiu del girasol, hacia un enfoque integral del problema. AGROUNS. Editorial de la Universidad Nacional del Sur. N° 33: 5-9. ISSN 1668-5946.

Funding

• PGI SECyT UNS 24/A253 “Estudios genómicos en mildiu de girasol y fusariosis de la espiga de trigo”. 2020 - 2024. IR Alicia Carrera.

• PGI SECyT UNS 24/B338 “Aporte del análisis de la expresión de genes en el estudio de la respuesta a patógenos”. 2023-2026. IR Marina Díaz

• PICT-2020-SERIEA-03002 “Mildiu de girasol en la Argentina: caracterización genética del patógeno y búsqueda de resistencia”. 2022-2026. IR Alicia Carrera.

• “Proyecto Cártamo: Promoción del cultivo, industrialización y comercialización del cártamo y sus derivados en la región subhúmeda y semiárida pampeana”. Multidisciplinario. UNS - Bolsa de Cereales y Productos de Bahía Blanca.  2023-2024. IR María Clara Franchini.

• Companies: Asociación de Cooperativas Argentinas, ACA Cabildo (Eng. Rubén Miranda) and Pergamino (Lic. Mauro Meier) and Buck Semillas (Eng. Lisardo González), Argentina

• INTA: EEA Balcarce (Dr. Facundo Quirós), Chacra Barrow Barrow (Dr. Adelina Larsen and Dr. Liliana Werhane), EEA Rafaela (Dr. Andrea Tomás) and Agencia Bahía Blanca (Dr. Carlos Torres Carbonell), Argentina
• Universidad Nacional de Río Cuarto, Departamento de Microbiología e Inmunología (Dr. Adriana Torres, Dr. Cecilia Farnocchi, Dr. Sofía Palacios).
• Servicio de Bioinformática y Bioestadística del Centro de Investigaciones Biológicas (CIB), Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), Madrid, Spain (Dr. Mario García Lacoba).
• Servicio de Bioinformática, CREA, Genomics Research Centre, Italy (Dr. Paolo Bagnaresi).

Group Members:

Dr. Marina Lucía Díaz
Research Assistant, Commission of Scientific Research of Buenos Aires Province (CIC) 
Teaching Assistant, Department of Biology, Biochemistry & Pharmacy, UNS




Dr. Daniela Soresi
Postdoctoral Fellow, CONICET
Teaching Assistant, Department of 
Biology, Biochemistry and Pharmacy, UNS 




Dr. Antonio Garayalde
Teaching Assistant,
Department of Mathematics, UNS




Dr. Lorena Armando
Teaching Assistant, 
Department of Agronomy, UNS



Agricultural Eng. Selva Cuppari
Postdoctoral Fellow, CONICET
Teaching Assistant,
Department of Agronomy, UNS 




Agricultural Eng. Ana Laura Martínez
Doctoral Fellow, CONICET